Para investir em títulos do Tesouro Direto é necessário contratar um Agente de Custódia, que são normalmente as corretoras ou instituições financeiras habilitadas para negociar estes títulos. Normalmente, os agentes de custódia cobram taxas que reduzem a remuneração do investimento. Apesar do Tesouro Direto ter permitido o acesso aos títulos do governo para investidores com menor capacidade financeira, os custos para esse investimento ainda são elevados: Taxa de custódia cobrada pela BM&FBOVESPA 0,30% ao ano Taxa de serviço cobrada pelo agente de custódia (Banco ou Corretora) 0,30% a 1% nos grandes bancos.